一般來說，深圳公司取消時要遵循的操作步驟如下:
1.清算
在深圳，公司注銷前，必須提前開展公司轉讓協議的企業清算和管理工作，具體包括停止在企業安全生產消費市場銷售主題的娛樂活動、結束企業各部門、結束訴訟、清理負債和債務、分配剩余資產等。在此過程中，公司需要按時開展以下管理工作:
(1)成立清算專家組。
(2)在清算管理過程中。其清算工作流程包括:移交企業資產、結束會見企業工作流程、扣除負債、清理債務、分配剩余資產、取消公司資格、吊銷許可證。
(3)通知債權人申請承擔責任。
(4)明確指出清算方案。清算企業資產、分配資產負債表和資產明細后，清算專家組將制定明確的清算方案，并報股東會討論依據或由部門確定。清算方案的主要思路是:清算成本、應付工資和職工保費、應付稅款、債權債務償還、剩余資產分配、清算終結管理等。
2.賬戶注銷
公司在深圳注銷需要在清算管理中進行。一般來說，深圳公司注銷時，必須到以下7家單位或機構申請并發銷戶。詳情如下:
(1)醫療保險中心。公司需要到企業住所地上海市社保局，查看是否有個人的醫保費用尚未還清，然后公司的轉賬協議部門注銷醫保賬號。
(2)稅務局。公司需要到周邊地區所屬的稅務局來檢查是否有欠稅或欠費，然后公司會取消州、地方稅務局。
(3)新聞媒體和報紙。公司需要獨立公布企業，并宣布企業即將銷戶。
(4)工商總局。申請并發企業登記注銷，并注銷其許可證。
(5)開戶行。公司注銷金融發行、銀行基礎賬戶等其他賬戶。
(6)質量技術監督局。如果企業的行業類別涉及制造企業的審批，公司需要到質量技術監督局辦理注銷許可證書。
(7)公安機關。取消公司印章的法律效力。
3.常見問題
公司在深圳注銷時，還應掌握以下公司注銷常見問題，以保證公司注銷工作的順利開展。
(1)深圳公司注銷周期一般為一至四個月。由于工商總局需要較少的債務，稅務局對公司的轉讓協議需要較少的稅收，公司也需要公示通知。
(2)公司注銷必須在公布后46天內進行。
(3)企業不申請并發銷戶，必須按時進行財務審批，否則會受到稅務局的處罰，特別是零星的納稅公司，必須按照所有正常的銷戶程序注銷公司，稅務局也會收回水印稅控系統。