2013年，國家稅務總局共收到“兩會”涉稅議案、建議和提案304件，其中十二屆全國人大一次會議代表議案、建議209件，全國政協十二屆一次會議委員提案95件。辦理工作已全部如期完成。
國家稅務總局歷來高度重視涉稅議案、建議和提案的辦理工作。稅務總局領導及時對辦理工作作出指示，要求承辦單位提高認識，強化責任落實，并親自研究審簽答復意見。辦公廳認真制定辦理工作方案，進一步明確了職責分工、復文要求和督辦等事項。各司局按照“提高認識，統一交辦，分別承辦，限時辦結，認真答復”的總體要求，強化措施，積極與人大代表、政協委員溝通，與有關部門協調，扎實辦理，保證了答復質量。
在辦理過程中，國家稅務總局堅持精心組織、保證質量和改進工作的要求，充分結合黨的群眾路線教育實踐活動，傾聽民聲，接受民主監督，認真吸收代表和委員建議，圍繞經濟社會發展和稅收工作實際，研究轉化成稅收工作具體的政策和措施，努力推動稅收改革發展。
“營改增”改革試點是打造中國經濟“升級版”的一項重要舉措，也是2013年全國“兩會”的熱點話題之一。如在人大第4142號建議和政協第059、0757、4811號提案中，有關代表和委員均提出了進一步推進“營改增”試點范圍擴大的建議。國家稅務總局在對上述建議和提案的答復中表示，按照國務院部署，稅務部門正在與有關部門共同推進此項改革穩步實施，其中：交通運輸業和部分現代服務業“營改增”試點工作已經于2012年在上海、北京等9個試點省市分批啟動運行。2013年8月1日，交通運輸業和部分現代服務業“營改增”試點在全國范圍推開，廣播影視作品的制作、播映和發行也被納入現代服務業的試點范圍。2014年1月1日，鐵路運輸和郵政業被納入“營改增”試點范圍。目前，各地“營改增”試點工作運行平穩，社會反響良好。隨著試點行業和地區的不斷擴大，“營改增”已駛入“快車道”，終將實現“十二五”期間在全國范圍內全面推行營業稅改征增值稅改革的目標。
兩會代表和委員十分關心我國的稅收立法工作，廣西代表團向惠玲等30名代表提出了《關于修改稅收征收管理法的議案》。國家稅務總局認為，代表們提出的關于實現稅收征管法與相關法律銜接等修改意見，對完善稅收征管制度具有重要意義。目前，國家稅務總局經充分吸收代表建議，認真研究起草并廣泛征求意見，已向國務院上報了稅收征管法修正案送審稿，希望繼續得到各位人大代表的指導。針對人大第51號《關于加快出臺中華人民共和國稅收基本法的議案》，國家稅務總局答復指出，制定稅收基本法可以對稅收活動中基礎性、帶共性的重要問題加以規范，這對于完善我國稅收法律體系，促進稅收職能作用的充分發揮具有十分重要的意義，建議全國人大常委會啟動稅收基本法的立法研究工作。同時，建議此項立法工作與目前正在實施的稅制改革，以及稅收暫行條例上升為稅收法律等工作統籌考慮、有機銜接。
除了對當前我國的各項稅收工作提出大量建設性意見外，不少代表和委員還在涉稅議案、建議和提案中表達了對民生問題的關注。侯云春委員提出第1463號提案，建議繼續利用稅收優惠政策鼓勵公租房市場發展，國家稅務總局答復表示，財政部和國家稅務總局已出臺關于支持公共租賃住房建設和運營有關稅收優惠政策的通知，政策到期后將根據具體情況對有關內容加以完善，以期繼續對鼓勵社會資金發展公共租賃事業起到積極作用。此外，還有不少代表和委員提出了涉及教育文化、醫療衛生、生態環境、注冊稅務師行業規范和個人所得稅制完善等多方面的建議，針對代表和委員們關心的這些問題，國家稅務總局均予以認真研究辦理并回復。