兩者的關系用一句話概括就是：公司是商標的載體。注冊商標，必須有一個載體(或者干脆就是所有人和持有人)，公司就是載體；有了公司(承運人)，你可以去注冊商標.
注冊商標需要一定的資質，即公司或個體戶的營業執照，其中個體戶可以負責人的名義申請，公司申請的商標權歸公司所有。
所以商標之前當然要有公司。可以先以朋友公司的名義申請商標，等有條件了再轉到自己名下。但是，要想在法律上完全擁有商標權，還是要先有自己的經營實體。
以下是關于注冊公司和注冊商標的具體介紹：
1.注冊公司就是你的商業身份。常見的有個體戶和有限責任公司。個體戶是公司的一種，個人承擔無限責任。一般個體戶適合一些風險不大的行業。有限責任公司是另一種，是法律認可的“人”，所以稱為法人。在法律層面，和自然人一樣，公司的所有者叫法定代表人。所以如果發生意外或者經營不善，公司只要損失0資產就可以宣布破產。作為法定代表人，你不用抵消你的私人財產。所以加工貿易等高風險行業是有限責任公司。有限責任公司大大降低了商人的商業風險，因此它的出現極大地促進了商業的進步。按其他性質可細分為股份公司、合資企業、獨資企業、外資等類型。
2.你的產品上貼了注冊商標，大家一看就知道，比如耐克的復選標記。類似于產權保護，你要保證別的鞋廠不能給自己的鞋子裝上和我一樣的檢查鉤。所以你需要注冊。我國規定商標只能歸公司/個體戶所有，自然人不能注冊。
綜上所述，公司是對外做生意的身份，也是保護機制。商標是公司擁有的資產。