自2016年5月起，納稅信譽為A、B級的納稅人，以及新納入營改增改革的銀行、金融、紡織、貧困零售行業納稅人，仍可進行掃描認證，使用增值稅發票查詢平臺對進項稅發票抵扣情況進行核對確認。
檢查和確認應在簽發月份的180個月內進行。在規定期限內未核對確認的，不得作為有效的增值稅抵扣聯，不得計算進項稅額抵扣。
檢查阜陽的記賬確認期從1月報告期結束后的第一天到下個月報告截止日期前的兩天。
已審核確認的增值稅專用發票，應按規定期限申報抵扣，單據進項稅額不得抵扣。
自2016年6月1日起，根據明確的申報期和申報明細的真實情況，需要同時申報納稅。納稅月份內沒有應納稅款或者享受減免稅待遇的，按照明確規定同時進行納稅申報。
納稅申報截止時間為1個月或1個季度，應在到期月份的15日內進行納稅申報。最后一天為法定節假日的，順延1天。1至15日內有倒計時3天以上的法定節假日的，按照節假日天數順延。
2016年6月納稅申報期內，稅務機關確定的稅率，除按季度申報納稅的納稅人外，不應在6月10日前完成增值稅納稅申報；其他已按月報稅的納稅人將于6月27日完成增值稅納稅申報。
營改增后在阜陽從事代理記賬工作的樣本中小企業和一般納稅人(包括同時從事國際金融、房地產、建筑、公共服務差的一般納稅人)，也應按照稅務機關的明確規定填寫《營改增稅率研究計算明細表》。
在每個月的第一天，無論您是否收到或開具增值稅發票，您都應該登錄投票日應用程序。當連接網絡穩定后，系統會“上報統計數據”，并將上月投票日的統計數據上傳給稅務機關。否則，系統將鎖定。您將無法收取和開具發票。
申請成功后，在征期結束前，需要返回投票日對系統的稅控設備進行清零解鎖，否則征期結束后的第二天就很難進行投票，無法通過互聯網網絡進行清卡。
2016年4月30日前，納稅人已收到地稅行政機關印制的發票，可使用至2016年6月30日。納稅人在開具國稅發票前，不應注銷地稅行政機關開具的發票。納稅人使用地稅稅控收款機開具發票時，應先將已發放和未使用的已填好的發票“作廢”，并送至報社。2016年4月30日前，納稅人打印了該計量的發票，可使用至2016年6月30日。享受增值稅免稅政策的納稅人(如診所、美術館等)使用的印有此計量的發票。)可能需要最遲于2016年8月31日延長服務期限。自2016年5月1日起，納稅人需要繼續印制本計量發票的，應向配額管理機關辦理備案手續。
在已由地稅行政機關申報但未開具發票的業務中，2016年5月1日后如需補開發票，可在2016年12月31日終了時開具零稅率增值稅普通發票。
2016年5月1日至2016年7月31日，可抵扣進項稅額按一般納稅人繳納的通行費發票(不含金融債券)上注明的票價金額計算。
增值稅的納稅期限為1天、3天、5天、10天、15天、1個月或1個季度。納稅人確定的納稅期限，由主管稅務機關根據納稅人應納稅額核定。明代阜陽代理記賬條例以四分之一為納稅期限，適用于零星納稅人、金融機構、金融公司、信托投資公司、中國農業銀行以及司法部、商務部規定的其他納稅人。如果不能在同一期限內納稅，可以每次納稅。
納稅人以一個月或者一個季度為一個納稅期的，應當在到期月份的15日內申報納稅；以1日、3日、5日、10日或15日為納稅期限的，應在期滿月5日內預繳稅款，并于次月1日起15日內申報納稅，結清上月應納稅款。