公司法確定了善意取得制度，即不能因為未辦理工商變認定股東轉讓股份無效，在符合善意取得制度的情況下，買方善意取得、支付合理對價、辦理相關手續(變更股東名冊)后，可以認為股權轉讓合同有效。
一、股權轉讓合同的生效、例外
原則上，成立時即生效時。但存在例外情況，如有關企業或行業轉讓股權需經許可、登記生效等，當事人也可以附條件、附期限。但雙方的約定違反上述規定的，轉讓無效。
二、股權轉讓合同的效力及變動的效力
不能因為未辦理登記，便認為股權變更未發生效力，這是兩個不同的法律關系。
確認股權的三大證據包括：基礎證據、推定證據、對抗證據。
在股東名冊和工商登記中，核心是股東名冊，如果股東名冊有相反證據可以推翻，工商登記可對抗第三人。如果股權訴訟中涉及股東資格認定時，應將公司列為第三人。
三、股東出資瑕疵，對股權轉讓效力的影響
瑕疵股權可以轉讓，但有可能構成可撤銷的情形，如果受讓方明知瑕疵仍讓愿意受讓，認定有效，但轉讓方惡意，受讓方不知，受讓方有撤銷權。
四、慎重對待無效、可撤銷合同
應當確立與人為善原則，能彌補的盡量彌補，按照有效、可撤銷、無效程序認定。
能認定有效的不要撤銷，能認定可撤銷的不要認定無效。
五、股權轉讓后，股東超過50人的合同效力
有限公司設立時規定股東不得超過50人，不過，并未規定股權轉讓后不得超過50人。實踐中較難做到，解決辦法：股權信托，可以有隱名股東。
六、一股多賣的問題
包括橫向，即一股賣給了數個受讓人;縱向，即甲賣給乙、乙賣給丙等。
具體的解決辦法包括：
1、盡量篩選出行使撤銷權的人，即退出購買返還股金;
2、繼續履行的，確認享有事實上、法律上優先購買權的股東有效;
3、無優先購買權的股東。
股權是準物權此法院應當裁判保護享有法定優先權的股東，即判決有優先購買權的股東股權轉讓有效。其余買家無效，但可以行使民事上的債權人權利。
如受讓人均簽訂了合同，且支付了轉讓款，則需要注意股權轉讓是否發生效力，股東名冊是否變更，如某一個已辦理變更，因受讓人已取得股東資格，原轉讓人就無權再轉讓，另一個轉讓就是無效的，無效的受讓人只能依據合同法追究原轉讓人的違約責任。